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北卡罗来纳州立大学研究人员创建了新的在线服务-Chemmaps-允许用户交互浏览化学空间8000多件药和47,000环境复合物3D实时Chemmaps设计为学生和研究人员核心资源,他们想容易视觉化并学习复杂化结构免费网站首发网站www.chemmaps.com.
Chemmaps的假设是制作Google药物地图,NC州化学助理教授Denis Fourches表示允许使用计算机或平面板者轻松浏览并浏览3D环境中营销药的化学空间切马普斯图形界面切合学生或医学化学专家的需要
化学像星-光点分布在屏幕上恒星或复合体基于结构属性与复杂化学空间内其他人相联用户点击特定复合星时显示该化学物的几个密钥特征:系统名称、品牌名称、化学结构、医学标识、外部标识符和其他物理化学属性
目前有两个主要地图可用药厂数据库编译约8 000种药(营销、开发并提取)环境地图或EnvMap包含47,000多种化合物(如杀虫剂或阻燃剂),与国家环境健康研究所和美国环境保护局相关,编译自tox21数据库、toxcast数据库和其他NIEHS数据库
研究人员计划随时间推移添加特征,包括协作方和公司直观化工集并投送专有化工集上Chemmaps并计划提高地图交互性、易操作性并兼容增强虚拟现实设备
Fourches表示:「这是公共领域首个工具, 允许任何人, 特别是化学学非专家,工具帮助研究者更好地了解 化学区块这对于药物重播或化学风险评估至关紧要
研究显示生物信息学.博士Alex Borrel前NC州后院研究员NEHS和论文第一撰稿人创建程序Fourches构思Chemmaps博士Nicole Kleinstreuer,NIEHS计算生物学家,也为工作出力
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探索药房mmaps.com
DOI:10.1093/bioinformatics/bty412
作者类Alexandre Borrel和Denis Fourches北卡罗来纳州立大学Alexandre Borrel和Nicole Kleinstreuer国家环境健康科学研究所
发布在线上网生物信息学
抽象性:
易于导航化学空间已变得更加重要,因为公众可访问数据库的大小和多样性越来越大,如Druppank数据库、ChEMBL数据库或tox21数据库建模者通常依赖复杂投射技术,使用分子描述器计算所有化学物可视化多化学步骤准备、定性、计算和探索这些分子是技术性的,通常需要脚本编程技巧,因此对非专家构成实实在在的障碍。我们开发mmaps.comwebserver容易浏览、导航和矿山化工空间第一版mmaps.com8000多特征开发中拒绝药和4.7万多环境化学物webserver免费上网www.chemmaps.com
