通过把狗变成人来“嗅出”淋巴瘤基因

北卡罗莱纳州立大学的研究人员正在缩小非霍奇金淋巴瘤相关基因的搜索范围——通过将狗变成人。

人类和狗不仅有共同的陪伴和生活空间，它们还有相似的基因组成。此外，他们有相同类型的癌症，包括淋巴瘤。马修·布林博士他使用犬类作为研究淋巴瘤的遗传模型，因为同品种的纯种犬之间的遗传变异比人类少，这使得更容易确定犬类染色体上可能与癌症有关的区域。

在一个发表在期刊上的论文白血病和淋巴瘤在美国，布林的团队从患有非霍奇金淋巴瘤的狗身上提取了遗传信息，然后对狗的基因组进行重新排列或“重新编码”，这样从基因组上讲，它们就变成了人类。然后，研究人员将犬类的基因组与非霍奇金淋巴瘤患者的基因组进行了比较，以确定哪些染色体与人类和犬类的癌症有关。

“这是我们第一次能够将患有淋巴瘤的狗的信息与被诊断患有同等癌症的人类患者的现有数据进行比较，并使用相同的技术，”Rachael Thomas博士说分子生物医学他是这篇论文的主要作者。

数据显示，只有少数与淋巴瘤有关的基因是狗和人共有的。这与目前对人类淋巴瘤的研究形成了鲜明对比，其中许多基因已被确定可能与癌症有关。布林和他的同事们希望这些数据能让研究人员找到最可能的基因元凶。

“从本质上讲，我们从人类数据中剥离了背景噪音，”布林说。“人类患者的淋巴瘤基因组学比狗患者复杂得多。这项研究告诉我们，虽然两个人?和狗吗?在临床和细胞水平上有类似的疾病，与相同癌症相关的基因变化在狗身上要简单得多。这表明，在人类癌症中可能有很多基因噪音，它们不是这个过程的重要组成部分。虽然人类研究已经在基因组的许多地方进行了研究，但狗的数据表明，我们需要关注哪些是共同的，而这些区域非常少。”

这项研究由美国国立卫生研究院和美国养犬俱乐部犬类健康基金会资助。分子生物医学科学系是北卡州立大学的一部分兽医学院。

皮克-

编辑注意事项:本文摘要如下。

通过对150只犬非霍奇金淋巴瘤中反复出现的DNA拷贝数畸变的“基因组编码”，提炼肿瘤相关的非整倍体

作者:Rachael Thomas, Alison Motsinger-Reif, Matthew Breen等，北卡罗来纳州立大学
发表:白血病和淋巴瘤, 2011年

文摘:
与非霍奇金淋巴瘤(NHL)发病机制最密切相关的基因组区域的鉴定被人类群体的遗传异质性所混淆。我们假设，纯种犬的有限遗传变异，结合人类和犬核型的对比结构，将增加两个物种中基本nhl相关染色体畸变的外显率。我们调查了150只犬NHL病例的非随机非整倍体，揭示了与人类相比有限的基因组不稳定性，并且没有证据CDKN2A / B犬b细胞NHL的缺失。将犬NHL数据“基因组重新编码”为“虚拟人类”染色体格式，显示两个物种之间共享的拷贝数畸变(CNA)区域非常少，仅限于狗的13号和31号染色体区域，以及人类的8号和21号染色体区域。我们的数据表明，通过对犬类患者中CNAs和肿瘤发病机制之间不太复杂的关联进行比较研究，NHL中的基因发现可能会得到加强。