培养自然
作为培育自然与培育辩论的培育方面的比分,因为北卡罗来纳州立大学遗传学家表明,如生活方式和地理等环境因素在某些基因是否被打开或关闭中发挥着大作用。
通过研究46个摩洛哥Amazighs的白细胞的基因表达,或者培养人 - 包括沙漠游牧民族,山地农业和沿海城市居民 - 摩洛哥和美国的NC国家研究人员和合作者展示了最多三分之一由于摩洛哥Amazighs居住的地点以及如何生活,基因差异化。
该研究发表在杂志Plos Genetics.。
NC国家研究人员,遗传学和富布莱特学者的NC国家研究生,以及Greg Gibson博士以前威廉·雷诺·雷诺伊州澳大利亚昆士兰大学遗传学教授为研究从传统到城市化生活方式的过渡对人类免疫系统的影响。他们使用最新工具来表征所有23,000名人类基因的序列和表达,以比较三个摩洛哥Amazigh组。选择这些群体,因为它们具有类似的遗传构成,但呈现不同的生命方式,占据不同的地理域。因此,三个组之间基因表达谱的差异可能是由于环境和不是遗传因素。
该团队未发现受生活方式和地理影响的特定基因和途径。例如,它们发现呼吸基因被上调,或者在城市人口中更频繁地开启,而不是游牧民族或农业人口。
这是有道理的,Idaghdour说,城市居民在城市造成较大量的污染,遇到哮喘和支气管炎等疾病的困难。因此,它增加了城市居民的某些呼吸基因在农村和游牧人口中保持安静的同时进入过载。
NC国家研究人员还在三种群体中的每一个中检查了每种基因,发现很少的遗传差异,赋予这些有限的差异不太可能解释大型基因表达差异。
虽然Idaghdour最初假设环境因素会在基因表达中发挥作用,但他并没有指出这种巨大的差异。城市居民和山地农业人员之间大约30%的基因差异化。
“The most important implication of this study is that people with the same genetic makeup can be in different environments and have different expression profiles,” Idaghdour says. “The same gene can be expressed in the city but not in a rural place because of the environment. So you must look at the environment when studying associations between genes and disease.”
- Kulikowski -
编辑的注意事项:纸张的摘要跟随。
“摩洛哥Amazighs白细胞环境地理基因组基因表达签名“
作者:Youssef Idagdour和Greg Gibson,北卡罗来纳州立大学;普林斯顿大学John D. Storyy;和Sami J. Jadallah,HRH Sultan Prince Sultan国际保护和开发野生动物,阿加迪尔,摩洛哥
发布时间:2008年4月11日,在Plos Genetics.
文摘:在不同的环境中,人类experience are likely to impact physiology and disease susceptibility. In order to estimate the magnitude of the impact of environment on transcript abundance, we examined gene expression in peripheral blood leukocyte samples from 46 desert nomadic, mountain agrarian and coastal urban Moroccan Amazigh individuals. Despite great expression heterogeneity in humans, as much as one third of the leukocyte transcriptome was found to be associated with differences among regions. Genome-wide polymorphism analysis indicates that genetic differentiation in the total sample is limited and is unlikely to explain the expression divergence. Methylation profiling of 1,505 CpG sites suggests limited contribution of methylation to the observed differences in gene expression. Genetic network analysis further implies that specific aspects of immune function are strongly affected by regional factors and may influence susceptibility to respiratory and inflammatory disease. Our results show a strong genome-wide gene expression signature of regional population differences that presumably include lifestyle, geography, and biotic factors, implying that these can play at least as great a role as genetic divergence in modulating gene expression variation in humans.
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