Finding the Switch: Researchers Create Roadmap for Gene Expression
在一项新的研究中，来自北卡罗来纳州立大学，Unc-Chapel山和其他机构的研究人员已经采取了创造路线图的第一步，这可能有助于科学家缩小众多疾病的遗传原因。他们的作品还阐述了新的光线，以如何影响基因表达。
Pinpointing the genetic causes of common diseases is not easy, as multiple genes may be involved with a disease. Moreover, disease-causing variants in DNA often do not act directly, but by activating nearby genes. To add to the complexity, genetic activation is not like a simple on/off switch on a light, but behaves more like a “dimmer switch” – some people may have a particular gene turned all the way up, while others have it only turned halfway on, completely off, or somewhere in between. And different factors, like DNA or the environment, play a role in the dimmer switch’s setting.
根据Fred Wright，NC统计和生物科学教授，NC州生物信息学中心主任和该研究的联合第一作者，“每个人都有相同的基因。难以确定哪些基因是可遗传的，或由您的DNA控制，而不是可能受到环境影响的那些基因。当您正在寻找与特定疾病的遗传关系时，扼杀遗传和环境之间的差异是缩小领域的关键。“
Wright，与Co-First Auther Patrick Sullivan，Unc-Chapel Hill遗传学和精神病学教授在Unc-Chapel Hill和精神科学学科和国家和国际同事中心，分析了来自2,752名成人双胞胎的血液样本数据（两者都是相同的和兄弟）从荷兰双床寄存器和荷兰的额外1,895名与会者的抑郁和焦虑研究。对于所有20,000个单独的基因，他们确定这些基因是否是可遗传的 - 受DNA“调光开关”的遗传控制 - 或主要受环境影响。
“相同的双胞胎具有相同的DNA，”赖特解释说，“如果基因是遗传的，那么它的表情在相同的双胞胎中比在兄弟双胞胎中更相似。此过程允许我们创建一个可遗传基因的数据库，然后我们可以与涉及疾病风险的基因进行比较。我们看到遗传基因更可能与疾病有关 - 可以帮助其他研究人员确定哪些基因在未来的研究中关注哪个基因。“
这项研究显示4月13日在线自然遗传学。
“这是迄今为止出版的基因表达最大的双胞胎研究，使我们能够制作基因与环境的路线图，”Sullivan说，并补充说该研究比以前可以更精确地测量与疾病的关系，并揭示了重要的联系近期人类演变和疾病遗传影响。
荷兰双床寄存器随访了25年以上的双对，并与纵向荷兰的抑郁和焦虑研究的合作建立了遗传和表达研究的资源。Dorret Boomsma教授，他开始了双创寄存器，“除了对遗传调控和疾病的基本洞察外，结果还提供了关于因果途径的有价值的信息。该研究表明，双门设计仍然是基因发现的关键工具。“
荷兰的血液样本由NiMH Cents处理罗格斯大学精神障碍的合作基因组学研究。国家统计国家研究学者益辉周和统计委员会Jung-ying Tzeng贡献了这项工作。该研究的资金包括来自国家精神卫生研究所和其他NIH研究所的赠品，荷兰科学研究组织，医疗系统生物学，生物分子和生物分子资源研究基础设施以及欧洲科学基金会和欧洲科学基金会欧洲研究理事会。
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Note to editors:纸的摘要跟随。
“外周血基因表达的遗传学和基因组学”
迪伊：10.1038 / ng.2951
作者：弗雷德A.Wright，NC州立大学;Patrick F. Sullivan，Unc-Chapel Hill，等
发布：Online April 13, 2014 in自然遗传学
抽象的：We assessed gene expression profiles in 2,752 twins, using a classic twin design to quantify expression heritability and quantitative trait loci (eQTLs) in peripheral blood. The most highly heritable genes (~777) were grouped into distinct expression clusters, enriched in gene-poor regions, associated with specific gene function or ontology classes, and strongly associated with disease designation. The design enabled a comparison of twin-based heritability to estimates based on dizygotic identity-by-descent sharing and distant genetic relatedness. Consideration of sampling variation suggests that previous heritability estimates have been upwardly biased. Genotyping of 2,494 twins enabled powerful identification of eQTLs, which we further examined in a replication set of 1,895 unrelated subjects. A large number of local eQTLs (6,988) met replication criteria, whereas a relatively small number of distant eQTLs (165) met quality control and replication standards. Our results provide a new resource toward understanding the genetic control of transcription.
