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NC州立大学地图烟草基因组

北卡罗来纳州立大学(North Carolina State University)的科学家们已经完成了一项耗时近五年、耗资1760万美元的研究,绘制了烟草基因组。

烟草基因组计划由美国菲利普莫里斯公司资助,随着该计划的完成,使烟草植物成为烟草植物的基因信息将向公众提供,植物病理学教授、该项目的联合主任查尔斯·奥普曼博士说。北卡罗来纳州立大学农业与生命科学学院(NC State College of Agriculture and Life Sciences)负责研究的临时副院长、大学负责研究的助理副校长史蒂文·隆梅尔(Steven Lommel)博士也指导了这项工作。

Opperman表示,遗传信息将通过国家卫生学院国家生物技术信息GenBank网站在线提供,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html,在北卡罗来纳州立大学的网站上,http://www.tobaccogenome.org/

一个有机体的基因组就是这个有机体的遗传蓝图。所有生物的基因组都是由DNA组成的,而DNA又由碱基或核苷酸分子组成。这些碱基—(由字母A, G, T, C â€)的出现顺序决定了一个有机体的身份。橡树和黑熊的基因组都是由相同的四个碱基组成的。橡树和黑熊的区别就在于碱基出现的顺序或顺序。

北卡罗来纳州农业与生命科学学院的科学家们确定了烟草基因空间的核苷酸序列,烟草基因组中包含基因和控制基因的遗传编码。Opperman说,烟草基因组包含大约45亿个碱基,是人类基因组的1.5倍;然而,烟草植物的基因组中只有20%到25%被认为是基因空间。

一种名为希克斯的烟草品种的基因空间被测序。Hicks是一种阔叶烤烟,它是北卡罗莱纳州烟草育种家和美国菲利普莫里斯公司建议用于该项目的,因为它已被用于育种广泛种植的烟草品种。

Opperman说,烟草基因组计划确定了可能是基因序列的部分或区域。他估计该项目发现了超过95%的烟草基因。

虽然该项目确定了烟草基因组中被认为是基因的部分,但它不一定决定基因的作用。

“我们可能可以给大约一半的基因分配身份,”Opperman说。“我们可以推测它们在做什么。”

他补充说,“抗性基因就是一个很好的例子。”这些基因帮助烟草植物存活或抵抗疾病、害虫或其他攻击。“我们可以识别很多看起来像抗性基因的东西,但不知道它们的作用。这需要别人自己去弄清楚。”

Opperman估计烟草含有大约36000个基因。

烟草被广泛用作一系列植物研究的模型,洛克指出,项目提供的信息应为植物科学家提供烟草以外的植物提供有价值的洞察力。该项目提供的信息将帮助科学家研究其他植物物种如何发展,产量和抵抗害虫和病原体。

烟草的基因蓝图在西红柿、土豆和辣椒等作物的研究中尤其有用,因为这些作物和烟草一样是茄科植物,在基因上也很相似。

烟草成为少数基因目录已被测序的植物之一。水稻的基因组已经进行了测序,就像水稻的基因组一样拟南芥Medicago truncatulaLotus对虾这些都是科学研究中使用的模型。包括玉米、大豆、番茄和土豆在内的一系列其他植物的测序正在进行中。

奥珀曼说,密苏里州圣路易斯的猎户座基因组公司在该项目中发挥了关键作用。NC State与Orion公司签订合同,使用该公司专有的Gene Thresher技术,该技术可以识别基因组的基因丰富区域。

奥珀曼说:“猎户座是一个很好的合作伙伴。

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