大线大线
对于许多科学家来说,这是一项顶峰成就:看到自己的名字被列为《科学》的合著者自然,高辛烷值的科学期刊中最高。
但对于北卡罗来纳州立大学的研究生本杰明·惠勒,发表在自然是偶然的研究。
作为生物信息学的博士生,惠勒加入了来自20个学术或研究组织的70多名共同作者自然3月14日发表论文,“Hydra动态基因组”。
虽然这篇论文揭开了一种小型海洋生物作为研究干细胞生物学的模型生物的面纱,但它也作为一个强有力的例子,说明了惠勒是如何通过一次偶然相遇而参与到这个项目中的。
协作和巧合
的路径自然最初是在校外,达特茅斯学院(Dartmouth College)生物学家凯文·j·彼得森(Kevin J. Peterson)博士在一个关于进化史模式的学术研讨会上遇到了北卡罗来纳州的昆虫学家布莱恩·维格曼(Brian Wiegmann)博士。
“凯文和我通过从基因组计划中寻找新的信息来支持关于动物长期进化假说的兴趣找到了共同点,”威格曼说。
彼得森研究MicroRNA - RNA片段调节一些细胞过程 - 以及在动物中演变的方式,以及在苍蝇中制作进化的“生命之树”的Wiegmann,决定合作。
彼得森在动物进化的研究中需要帮助。Wiegmann咨询了他的计算机科学同事,找到了从事统计遗传学和计算生物学研究的Steffen Heber博士。统计遗传学和计算生物学是比较基因集合的研究,这需要对大数据集进行理解。反过来,赫伯建议他的计算机科学研究生惠勒。
因此,惠勒着手开发一种计算机程序,可以帮助彼得森找到基因组尚未测序的动物体内的小rna。其中一个就是九头蛇。这个项目成为惠勒硕士论文的重点,并最终让他登上了科学期刊的鼻祖。
开采小分子核糖核酸
学习MicroRNAS是了解更多关于进化的好方法,因为片段通过祖先传递而没有变化。然而,微大罗斯作为生物而加入,因此当有机体分支在家庭树上时,新的片段很明显。
Wheeler的计算机程序称为MIRMINER,检查了RNA序列以找到新的MicroRNA。
“没有它,我们不可能完成我们的microRNA工作,”彼得森说。“和本一起工作很容易——主要的困难是在我们有数据之前试图将数据概念化。”
“我当时没有想到任何东西;通过该程序运行,它只是一组更多的数据,“惠德说他在Hydra MicroRNA上的工作。“我将信息邮寄给彼得森博士,两年后,有什么内在的东西。”
学校诗齐
研究和协作的偶然性 - 了解与可能能够帮助的人合作的人 - 在自然纸上的惠勒的角色中清楚地清楚。但它还采用了一些偶然性,在2006年将惠勒和NC州提供惠勒。
惠勒是宾夕法尼亚州蒂尔学院(Thiel College)计算机科学和数学专业的一名优秀学生,她最初申请了四所研究生院。在没有收到录取通知书的情况下,惠勒又投了三轮申请,其中一轮是北卡罗来纳州立大学。
“北卡罗来纳州立大学录取了我,并给了我资金,”他回忆道。“但是我需要尽快决定是否接受这份工作。我还没有收到其他学校的消息,所以这是一个比较容易的决定。'这是到手的机会,所以我要到州里去。'”
对惠勒和他的妻子凯蒂来说,靠近宾夕法尼亚州也很重要。另外,她很快在D.H. Hill图书馆找到了一份工作。
对北卡罗来纳州立大学来说是件好事。结果,惠勒最终接受了他的另外两个选择,并从他们那里获得了资金。因为在正确的时间出现在正确的地点而获得另一场胜利。
从海洋生物到剪接
在他的博士学位上,惠勒在北卡罗来纳州立大学百年校园生物信息学研究中心的工作将他的重点转向了所谓的选择性剪接。
在细胞中,遗传信息被用来制造蛋白质,蛋白质指导细胞的化学反应。在这个复杂的过程中,RNA链被剪接。
惠勒和赫伯正在研究选择性剪接(RNA以多种方式剪接形成多种蛋白质)是否在细胞中发挥了功能作用,或者这是一种处理错误。
在人类中,选择性剪接与疾病有关——该假说认为,剪接错误会导致蛋白质产生错误,这对人体有有害影响——但研究才刚刚开始触及这个问题的表面。
这一次,惠勒正在研究植物世界的实验室鼠,Arabadopsis芥或者芥末杂草,具有高替代拼接的速度。他试图衡量替代拼接是否用作工厂中的功能的关闭开关,或者只是随机错误。
惠勒预计将在两年内获得生物信息学博士学位,并表示他希望在大学或实验室进行研究。
这是惠勒足以为科学提供更多贡献,作为NC州立学生,偶然或没有。

当有足够的知识共享时,偶然就会发生静态,以允许其他丢失的连接发生。伟大的故事。