通过将狗转化为人类，“嗅出”淋巴瘤基因

北卡罗来纳州立大学的研究人员正在缩小寻找非霍奇金淋巴瘤的基因 - 通过将狗转化为人类。

人类和狗不仅仅是分享陪伴和生活空间，他们也分享了类似的遗传妆容。此外，它们共享相同类型的癌症，包括淋巴瘤。马修·布林博士是NC状态的基因组学教授，使用犬类作为研究淋巴瘤的遗传模型，因为同一品种的纯种犬比人类所做的遗传变异较少，使得在癌症染色体上可以更容易地定位癌症的区域。

在一个发表在期刊上的论文白血病和淋巴瘤，布雷登的团队从非霍奇金淋巴瘤的狗带来了遗传信息，然后重新排列或“重新编码”狗的基因组，使统一说话，它们是人类的。然后，研究人员将核糖的犬类基因组与具有非霍奇金淋巴瘤的人类进行比较，以了解哪些染色体与人类和犬类中的癌症涉及。

“这是我们第一次将这些信息与淋巴瘤直接与人类患者的现有数据与诊断出同等的癌症和使用相同的技术进行比较，”Rachael Thomas博士学习助理教授分子生物医学科学在NC州和涉文的铅作者。

数据显示，只有少数基因涉及由狗和人类共享的淋巴瘤。这与当前研究人淋巴瘤的研究形成鲜明对比，其中许多基因已经确定可能与癌症有关系。Breen和他的同事希望这一数据将研究人员指向最有可能的遗传罪魁祸首。

“实质上，我们从人类数据中剥离了背景噪音，”布雷登说。“淋巴瘤基因组学在人类患者中具有比狗患者更复杂。这项研究告诉我们，虽然是人类？和狗？在临床和细胞水平上具有可比性疾病，与同一癌症相关的遗传变化在狗的复杂程度不那么复杂。这表明人类癌症中可能存在很多遗传噪声，这些癌症不是该过程的必要组件。虽然人类研究一直在基因组中的众多地方，但狗数据表明我们需要专注于共享的内容，这些都是很少的地区。“

这项研究是由美国国立卫生研究院和美国犬舍俱乐部犬类健康基金会资助的。分子生物医学科学系是北卡罗来纳州立大学的一部分兽医学院。

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编辑:摘要纸张跟随。

通过对150例犬非霍奇金淋巴瘤复发性DNA拷贝数畸变的“基因组编码”改进肿瘤相关非整倍体

作者：rachel Thomas, Alison Motsinger-Reif, Matthew Breen等，北卡州立大学
发布：白血病和淋巴瘤, 2011年

抽象的：
鉴定与非霍奇金淋巴瘤（NHL）发病机制最紧密相关的基因组区域被人口的遗传异质性混淆。我们假设纯种犬的限制遗传变异，与人和犬核型的对比架构相结合，将增加两种物种中基本NHL相关染色体畸变的渗透。我们在150个犬NHL病例中调查了非随机的非血换，与人类对应相比，揭示了有限的基因组不稳定，没有证据CDKN2A / B.在犬B细胞NHL中删除。‘Genomic recoding’ of canine NHL data into a ‘virtual human’ chromosome format showed remarkably few regions of copy number aberration (CNA) shared between both species, restricted to regions of dog chromosomes 13 and 31, and human chromosomes 8 and 21. Our data suggest that gene discovery in NHL may be enhanced through comparative studies exploiting the less complex association between CNAs and tumor pathogenesis in canine patients.