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抽象的

钓鱼见解人类健康

斑点姜(Lepisosteus Oculatus)。信誉:所罗门大卫

花斑雀鳝(Lepisosteus Oculatus)是一个不寻常的长期鱼类,最常见于美国和墨西哥湾海湾沿岸,但它可以在北部南部的北方等距。由于白垩纪时期,鱼类在相对不变的状态下幸存下来,并且通常被称为“活化石”。在遗传学方面,斑点的玉米是特殊的,因为在紧邻紧邻Textole基因组重复(TGD)之前,它的谱系是从其他极端的血管分叉。

在最近的问题中自然遗传学是由俄勒冈大学领导的一群研究人员宣布探讨了斑点GAR的基因组的测序。他们希望这种基因组 - 从其祖先保守相对不变的染色体 - 将使我们洞察人类演变和人类健康。

杰夫·尤德(Jeff Yoder)是北卡罗来纳州立大学兽医学院(NC State 's College of Veterinary Medicine)的免疫学副教授,也是gar基因组计划的贡献者之一。他同意就斑点雀鳝基因组的重要性进行简短的问答。

什么是蒜的独特 - 他们像鳄鱼一样,在基因组的原始过去的基本上没有改变?为什么他们独特的基因组有助于与人类的比较?
GAR是独一无二的,因为它们正在慢慢发展,所以可以提供对古代基因组可能看起来的洞察力的洞察力。它们也是特殊的鱼类,因为他们来自更古老的血统,没有复制他们的基因组(就像所有的外政)。研究人员认为,TGD大约3.5亿年前的祖先的所有紧邻的祖传物种,但与甘队无关的人。在TGD重复发生时,该原始电源物种中每种基因将存在两种副本。然而,在进化时间上,每个基因的一份副本中只有压力以维持功能。然后“允许”每种基因的第二拷贝累积以累积可能改变基因函数和/或已经足够突变以失去功能并变得无法辨认的突变。

随着更多的突变发生,更多的硬骨鱼物种出现,据估计,目前地球上有超过26000种硬骨鱼。由于TGD和硬骨鱼的后续进化在不同的硬骨鱼基因组之间产生了如此复杂的多样性,有时很难将硬骨鱼(如斑马鱼,通常用于这一目的)的基因组与人类基因组进行直接比较,反之亦然。有了gar基因组作为参考,硬骨鱼基因组和人类基因组的比较应该会更容易。

gar基因如何帮助我们更多地了解人类疾病?
通过TGD,TeactoSts积累了可能为特定物种提供益处的额外基因副本,但不是必不可少的。由于GAR没有经历TGD,我们假设其基因组将类似于紧邻的基因组,而是更加反映人类中存在的基因的基本基因集合。GAR基因组将帮助研究人员使用Textosts来模拟人类疾病的筛选,这些额外的紧邻基因。目标是能够更好地比较与人类基因组有关的基因,从而提供更加关注人类患者研究的基因。

我们发现的一个很好的例子是,对于一类识别病原体的一类免疫受体,一些玉米受体与人类受体更类似于人类受体,而其他GAR受体与紧邻受体更类似于人类受体。这真的展示了大豆的古代性质,因为它与幽灵和人类分享了基因组特征。通过这些数据,我们现在可以更好地了解编码这些免疫受体的基因在数十亿多年中发育出来,这些分析将有助于设计旨在了解这些受体在人类和鱼类中这些受体的典型角色的实验健康。

您参与该项目是什么?
我带领一组比较免疫学家分析了gar基因编码的免疫基因。这个小组包括我的功能基因组学研究生Dustin Wcisel,以及佛罗里达州圣彼得堡的南佛罗里达大学、日本叶山高等研究研究生大学和华盛顿州西雅图的Benaroya研究所的专家。

本研究中的下一步是什么,如果有的话?
随着许多免疫相关基因在物种中显示出遗传多样性,我们有兴趣查看各种服之间免疫基因的多样性。虽然比其他实验室模型(例如斑马鱼)更慢,但在分析许多脊椎动物发育和生理特征时,在实验室中,GAR胚胎的可用性和对成年人的易于提升鸡蛋的易用性。

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